Prawdopodobnie istnieją pewne różnice w obrazie klinicznym zespołu Aspergera w zależności od płci. Nie zostało to jeszcze odpowiednio udokumentowane przez szeroko zakrojone badania epidemiologiczne. Z mojego doświadczenia wynika, że dziewczęta z zespołem Aspergera są czasami mniej agresywne, mniej podatne na nadpobudliwość i nie są tak bardzo zainteresowane określonymi wąskimi zainteresowaniami. Zwykle są bardziej zainteresowani zabawkami „towarzyskimi”, takimi jak lalki, podczas gdy chłopcy często wykazują większe zainteresowanie twardymi przedmiotami, wodą, piaskiem i mechanicznymi przedmiotami. Całkiem możliwe, że wszystkie te rozbieżności mają związek z podobnymi cechami różnicującymi między płciami w populacji ogólnej. Niemniej jednak mogą być ważne, ponieważ męski prototyp zaburzeń ze spektrum autyzmu jest tym, który był promulgowany prawie wyłącznie w ciągu ostatnich 50 lat. Te nieliczne dziewczęta, u których w przeszłości zdiagnozowano autyzm, były zwykle poważnie dotknięte, często z poważnymi objawami uszkodzenia mózgu. Może to wynikać z faktu, że duża część wszystkich dziewcząt z zaburzeniami ze spektrum autyzmu – szczególnie tych, które funkcjonują w wyższym stopniu – mogła zostać niewykryta w tych badaniach, przekazując fałszywą wiadomość, że dziewczynki z autyzmem są bardziej upośledzone